MSc Bioinformatics(University of Sussex), 博士(理学・大阪大学)
総合情報学科 教授
先端データ科学研究センター センター主事
大学院 総合情報学研究科 専攻主事
コンピュータ部 部長 (2022.4 〜）
料理愛好会 顧問 (2023.12 〜）

生体分子間相互作用のメカニズム解明に向けたデータ解析や、それを予測するための機械学習法に基づく方法論の開発に取り組んでいます。また、創薬研究に有用な各種データベースやツール開発にも取り組んでいます。詳しくは研究業績をご覧ください。

【主な研究テーマ】
タンパク質間相互作用の進化的及び物理化学的な解析
タンパク質間相互作用を予測するためのシステム開発
生命科学研究に有用なデータベースやツールの開発

【開発に携わった現在稼働中のWebアプリケーション】
・ NLDB (Natural Ligand Database) タンパク質と天然化合物の複合体DB
・ PSOPIA (Prediction Server of Protein-Protein Interactions) タンパク質間相互作用予測サーバ
・ PSIVER (Prediction Server of Protein-Protein Interactions Sites) タンパク質相互作用部位予測サーバ
・ surFit (SurFit Web Server) タンパク質間ドッキングサーバ

【大学教員紹介】 【ResearchMap】 【ORCiD】

私は教育関連のアプリケーションに興味があり、人の役に立つアプリケーション作りたいと考えています。また、今後のゼミ活動を通して、コミュニケーション能力を伸ばしていき、充実した大学生活を送りたいと考えています。

ゼミのみんなとともに成長し、ゼミでの活動をより良いものにしていきたいです。特に、コミュニケーション能力やプログラミングの能力を高め、将来社会に出ても役に立てるように成長していきたいです。

私は現在、小、中学生に向けた教育プログラムに対し興味を持っており、実際に自分で開発をしたいと考えています。ゼミ活動ではゼミ生と意見交換をたくさんし、お互いを高めあっていけたらいいなと考えています。

元々医療系に興味があり、今学んでいる情報系を通して、現在の医療業界に役立つシステムを開発したいと思っています。その為に村上ゼミで分析したり活発に意見交換したりして、同じゼミ生と一緒に成長して行きたいです。

娯楽に関する研究をしたいです。よろしくお願い致します。

動物関係に興味があります。ゼミでの研究を通して自分の将来の糧になるような力を身に付けていきたいと思っています。また、世界中のペットが健康に暮らせるような研究をしていきたいと考えています。

がんばりたい

私はヘルスケアの分野に興味を持っています！ですが、まだ浅い部分にいるので村上ゼミで個性豊かなメンバーと共に研究や見聞を深めていけるように頑張ります！

ゼミでの活動を通して、研究分野を探していきたいと思っています。 また、周りとコミュニケーションをとり、切磋琢磨しながら人として成長していきたいです。

ゼミでの活動を通して、プログラミングや集団で協力する力を磨いていきたいです。 今はまだどのような研究をするかは決めていませんが、人の役に立つソフトウェアの開発をしたいです。

私は高齢者支援に関する研究に興味があります！ゼミの活動を通して村上ゼミのメンバーと共に高め合って行けるように頑張りたいと思います！

研究はヘルスケアについて興味があります。よろしくお願いします。

今はまだ明確な研究内容を定めていませんが、健康に関するアプリケーション又はゲームを作りたいと考えています。自分で開発ができるようになるために、ゼミ活動を通してプログラミングの技術を高められるよう頑張りたいです。

私はVR、AR技術に興味があります。この技術を用いて体の不自由な方や心に問題を抱えている子供たちを楽しませることが出来るようなソフトウェア開発をしたいと考えています。村上先生やゼミのメンバーとも積極的に話し合い、より良いものを作っていきたいです。

睡眠と周囲環境、特に音や音楽との関わりについて興味があります。

大学に入学した際にやりたかったこと、運動と情報技術をうまく活かして生活を豊かにできるようなシステム開発をしていきたいと考えています。 ゼミ内での行事にも積極的に参加していき、先輩方や教授との親睦を深めたいきたいです。

この2年間は、自分のやりたいことを見つけて希望する企業に就職できるように頑張ります。 普段の生活からゼミで開催されるイベントまで、最後まで楽しく過ごしたいと思います。よろしくお願いします。

ゼミ活動を通じてプログラミングの技術など将来の自分のためになる能力を磨きつつ、ゼミのメンバーと仲良くなって色々な事を協力してやっていきたいと思います。まだどのような研究をするかは決めていませんが、村上ゼミで様々な事を学び研究テーマを決めていければいいなと思っています。

ゼミを通して社会問題に対しての課題発見力やそのための問題解決力を身につけ、これからの社会に大いに貢献したいと考えています。また、今後のゼミ活動を通して、積極的に取り組んでいき、ゼミの仲間たちと良い関係性を築いていきたいです。

抱負は、積極的にゼミ活動に参加し、自分の知識を深め、独創的な考え方だったり新たな視点をもって他メンバーと協力して研究活動をしたいです。またこの研究を通して社会で必要とされるような人間に成長していきたいと考えています。

今後のゼミ活動では、専門知識を深め、視野を広げることを目指します。また、クラスメートと良好な関係を築くことも重要視しています。ゼミは、リラックスした楽しい雰囲気の中で過ごしたいと考えており、互いに学び合い、支え合うことで、有意義なゼミライフを送りたいです。

ゼミの活動を通して問題解決能力とコミュニケーション能力を高めて、充実した大学生活を送りたいなと考えています。どうぞよろしくお願いします。

私はまだ自分がどのような分野の研究がしたいのかは明確には決まってはいないのですが、このゼミ活動での様々な活動をとにかくがむしゃらに頑張って、自分の研究したい分野を見つけて後悔大学生活を送れるように努力していきたいです。

ゼミ活動を通して、コミュニケーション能力と自分の技術力を向上させたいと思います。人の役に立つようなものの研究をしたいと考えています。

私は世の中のヘルスケアに貢献できるアプリケーションを開発したいと考えています。技術の成長はもちろん、メンバーとのコミュニケーションを通じて人とのかかわり方等も学び、成長していきたいと考えています。率先してゼミ活動に関わることによる、自身の成長も目指していきたいです。

私が面白いと思える研究を一生懸命に取り組む事です。 今までに熱量を持って何かを成し遂げた経験が少なくひとつでも全力で取り組める物事があればと考えています。 なので村上ゼミでは、興味関心のある生命情報の分野で楽しい、面白いと思える研究を行いたいです。

ゼミでは研究に力を入れながら多くのことに挑戦していきたいです。

ゲームが好きなのでゲームに関係する研究をしてみたいです。 ゼミ活動にも積極的に参加して楽しく過ごしていきたいです。

株式会社アイフロント、株式会社アクト、ＡＲアドバンストテクノロジ株式会社、株式会社ウィズ・ワン、株式会社エスユーエス、株式会社大崎コンピュータエンヂニアリング、株式会社アウトソーシングテクノロジー、ＮＴＴテクノクロス株式会社、株式会社エイ・エス、株式会社アーバン・コーポレーション株式会社、株式会社エス・イー・シー・ハイテック、アノテーション株式会社、株式会社アトラスコンピュータ、株式会社アズパートナーズ、株式会社エー・アール・シー

グロースエクスパートナーズ株式会社、株式会社クレスコデジタルテクノロジーズ、株式会社キューブシステム

株式会社CIJネクスト、ソフトウエア情報開発株式会社、株式会社サンソウシステムズ、ジャストエンジニアリング株式会社、CTCテクノロジー株式会社、株式会社システナ、株式会社スピリッツ・ワン、株式会社ソフトウェアコントロール、Sky株式会社

株式会社タカサ、株式会社東和コンピュータマネジメント、株式会社DSK

ナビオコンピュータ株式会社、日本マニュファクチャリングサービス株式会社

富士ソフト株式会社、株式会社富士通ソーシアルサイエンスラボラトリ（現、富士通株式会社）、株式会社はま寿司、株式会社プラムシックス、プログレス・テクノロジーズ株式会社、ハイディメンション株式会社、北港情報サービス株式会社、株式会社日立情報通信エンジニアリング

ミツイワ株式会社、Modis株式会社、ムトーアイテックス株式会社、株式会社monoii、株式会社マルハン

株式会社陽進堂、株式会社ユニスティ

株式会社両毛システムズ、株式会社ＹＳＬソリューション

ワールドビジネスセンター株式会社

学校法人花沢学園 明聖高等学校

東京情報大学大学院総合情報学研究科

有澤文太（2022年度卒）
上田さつき（2023年度卒）
佐藤大宙（2023年度卒）

★5期生（2023年度卒）
青木尚士　岩崎智哉　鈴木貴大　須藤寛久　高岡倖太朗
髙徳一聖　戸谷汐里　中島恭哉　野口真広　野村文乃
山井彩花　山田倖志　李嘉一　渡邊輝