MSc Bioinformatics(University of Sussex), 博士(理学・大阪大学)
総合情報学科 教授、学部長
コンピュータ部 部長 (2022.4 〜）
料理愛好会 顧問 (2023.12 〜）

生体分子間相互作用のメカニズム解明に向けたデータ解析や、それを予測するための機械学習法に基づく方法論の開発に取り組んでいます。また、創薬研究に有用な各種データベースやツール開発にも取り組んでいます。詳しくは研究業績をご覧ください。

【主な研究テーマ】
タンパク質間相互作用の進化的及び物理化学的な解析
タンパク質間相互作用を予測するためのシステム開発
生命科学研究に有用なデータベースやツールの開発

【開発に携わった現在稼働中のWebアプリケーション】
・ NLDB (Natural Ligand Database) タンパク質と天然化合物の複合体DB
・ PSOPIA (Prediction Server of Protein-Protein Interactions) タンパク質間相互作用予測サーバ
・ PSIVER (Prediction Server of Protein-Protein Interactions Sites) タンパク質相互作用部位予測サーバ
・ surFit (SurFit Web Server) タンパク質間ドッキングサーバ

【好きな言葉】
「高い壁の向こうには新しい発見と可能性が広がる未来がある。」

【大学教員紹介】 【ResearchMap】 【ORCiD】

　　 2024年度翔風祭

　　 2023年度翔風祭

今はまだ明確な研究内容を定めていませんが、健康に関するアプリケーション又はゲームを作りたいと考えています。自分で開発ができるようになるために、ゼミ活動を通してプログラミングの技術を高められるよう頑張りたいです。

4年生になり、バイオインフォマティクスの分野に非常に興味が湧きました。がんとタンパク質の相互作用ネットワークに関するものをテーマにしたいと考えています。ゼミ長として、ゼミの皆をしっかりと引っ張っていけるよう頑張ります。

睡眠と周囲環境、特に音や音楽との関わりについて興味があります。

大学に入学した際にやりたかったこと、運動と情報技術をうまく活かして生活を豊かにできるようなシステム開発をしていきたいと考えています。 ゼミ内での行事にも積極的に参加していき、先輩方や教授との親睦を深めたいきたいです。

この2年間は、自分のやりたいことを見つけて希望する企業に就職できるように頑張ります。 普段の生活からゼミで開催されるイベントまで、最後まで楽しく過ごしたいと思います。よろしくお願いします。

ゼミ活動を通じてプログラミングの技術など将来の自分のためになる能力を磨きつつ、ゼミのメンバーと仲良くなって色々な事を協力してやっていきたいと思います。まだどのような研究をするかは決めていませんが、村上ゼミで様々な事を学び研究テーマを決めていければいいなと思っています。

ゼミを通して社会問題に対しての課題発見力やそのための問題解決力を身につけ、これからの社会に大いに貢献したいと考えています。また、今後のゼミ活動を通して、積極的に取り組んでいき、ゼミの仲間たちと良い関係性を築いていきたいです。

抱負は、積極的にゼミ活動に参加し、自分の知識を深め、独創的な考え方だったり新たな視点をもって他メンバーと協力して研究活動をしたいです。またこの研究を通して社会で必要とされるような人間に成長していきたいと考えています。

今後のゼミ活動では、専門知識を深め、視野を広げることを目指します。また、クラスメートと良好な関係を築くことも重要視しています。ゼミは、リラックスした楽しい雰囲気の中で過ごしたいと考えており、互いに学び合い、支え合うことで、有意義なゼミライフを送りたいです。

ゼミの活動を通して問題解決能力とコミュニケーション能力を高めて、充実した大学生活を送りたいなと考えています。どうぞよろしくお願いします。

私はまだ自分がどのような分野の研究がしたいのかは明確には決まってはいないのですが、このゼミ活動での様々な活動をとにかくがむしゃらに頑張って、自分の研究したい分野を見つけて後悔大学生活を送れるように努力していきたいです。

ゼミ活動を通して、コミュニケーション能力と自分の技術力を向上させたいと思います。人の役に立つようなものの研究をしたいと考えています。

私は世の中のヘルスケアに貢献できるアプリケーションを開発したいと考えています。技術の成長はもちろん、メンバーとのコミュニケーションを通じて人とのかかわり方等も学び、成長していきたいと考えています。率先してゼミ活動に関わることによる、自身の成長も目指していきたいです。

私が面白いと思える研究を一生懸命に取り組む事です。 今までに熱量を持って何かを成し遂げた経験が少なくひとつでも全力で取り組める物事があればと考えています。 なので村上ゼミでは、興味関心のある生命情報の分野で楽しい、面白いと思える研究を行いたいです。

ゼミでは研究に力を入れながら多くのことに挑戦していきたいです。

ゲームが好きなのでゲームに関係する研究をしてみたいです。 ゼミ活動にも積極的に参加して楽しく過ごしていきたいです。

ゼミの活動を通して、様々な技術や知識を身に着けたいと考えています。CG等を活用したプロジェクションマッピングについて研究したいと考えています。

ゼミの活動を通してコミュニケーション能力とチームでの問題解決能力を高めていきたいです。また研究テーマに関してはまだ決めていませんが、人の集中力に関する研究をしてみたいと考えています。

タンパク質について、研究をしていきたいと思っています。筋肉とタンパク質はとても重要な関係を担っており、それについて、村上ゼミで一生懸命勉強していきます。

今年はとにかく爬虫類の研究をします。爬虫類のタンパク質と紫外線量で体格は大きくなるのか。給仕量でどのくらい変わるのか。細かい作業が続きますがしっかりしたデータを作りたいです。

株式会社アイフロント、株式会社アクト、ＡＲアドバンストテクノロジ株式会社、株式会社ウィズ・ワン、株式会社エスユーエス、株式会社大崎コンピュータエンヂニアリング、株式会社アウトソーシングテクノロジー、ＮＴＴテクノクロス株式会社、株式会社エイ・エス、株式会社アーバン・コーポレーション株式会社、株式会社エス・イー・シー・ハイテック、アノテーション株式会社、株式会社アトラスコンピュータ、株式会社アズパートナーズ、株式会社エー・アール・シー、株式会社オプティマ、株式会社エヌアイデイ

グロースエクスパートナーズ株式会社、株式会社クレスコデジタルテクノロジーズ、株式会社キューブシステム

株式会社CIJネクスト、ソフトウエア情報開発株式会社、株式会社サンソウシステムズ、ジャストエンジニアリング株式会社、CTCテクノロジー株式会社、株式会社システナ、株式会社スピリッツ・ワン、株式会社ソフトウェアコントロール、Sky株式会社、首都圏システム開発株式会社、株式会社CIC、株式会社シーエーシー

株式会社タカサ、株式会社東和コンピュータマネジメント、株式会社DSK、株式会社津田屋、株式会社テクノプロ・デザイン社

ナビオコンピュータ株式会社、日本マニュファクチャリングサービス株式会社

富士ソフト株式会社、株式会社富士通ソーシアルサイエンスラボラトリ（現、富士通株式会社）、株式会社はま寿司、株式会社プラムシックス、プログレス・テクノロジーズ株式会社、ハイディメンション株式会社、北港情報サービス株式会社、株式会社日立情報通信エンジニアリング、北港情報サービス株式会社、株式会社日立社会情報サービス

ミツイワ株式会社、Modis株式会社、ムトーアイテックス株式会社、株式会社monoii、株式会社マルハン

株式会社陽進堂、株式会社ユニスティ、株式会社ユニキャスト

株式会社両毛システムズ、株式会社ＹＳＬソリューション

ワールドビジネスセンター株式会社

学校法人花沢学園 明聖高等学校

東京情報大学大学院総合情報学研究科

有澤文太（2022年度卒）
上田さつき（2023年度卒）
佐藤大宙（2023年度卒）

★1期生(2019年度卒） 伊藤　翔
稲垣　匠
大村　結香
大森　亜美
柏野　佑太朗
小林　寛明
佐藤　幹太
佐藤　翔太
瀧澤　莉惠
畑山　嵩典
原子　真実
脇坂　政由紀

★2期生（2020年度卒） 有澤　文太
稲葉　祐哉
岡野　晟
金森　雄輔
北村　悠斗
久保　剛史
小林　怜雄
佐藤　匠
白沢　大地
高平　雄太
丸杉　弥世都
李　佳霖

★3期生（2021年度卒） 飯沼　北斗
池谷　柊
伊東　辰哲
上田　さつき
大村　諒人
喜多　健太郎
坂本　悠太
佐々木　資生
佐藤　大宙
間中　亮佑
眞部　悟
毛呂　藍夏
山畠　唯子

★4期生（2022年度卒） ウォン　スー　シェン
古畑　裕基
仲村　勇輝
棚橋　飛斗
中林　大樹
永井　翔
関矢　直樹
峯村　颯汰
兒玉　爽花
松尾　真紀
仲皿　晃太
中島　結香
鈴木　優介

★5期生(2023年度卒） 青木　尚士
犬伏　利貴
岩崎　智哉
鈴木　貴大
須藤　寛久
高岡　倖太朗
高徳　一聖
戸谷　汐里
中島　恭哉
野口　真広
野村　文乃
山井　彩花
山田　倖志
李　嘉一
渡邊　輝

★6期生(2024年度卒） 伊藤　翼
大垣　颯悟
小川　颯輝
小野　祥太
河野　ひより
助森　ひなた
高橋　雅弥
瀧口　光正
中居　瑠太
能登　胡羽
茂垣　光
森久　勇太
山口　丈瑠
リョウ　ギョク